Cytoscape

Pachetul Cytoscape a fost realizat pe bază programului dezvoltat de http://www.cytoscape.org.

Conform http://www.cytoscape.org

“Cytoscape este o platformă cu sursă deschisă pentru vizualizarea rețelelor căilor de interacțiune moleculară și biologice și completarea acestor rețele cu adnotări, profile de expresie genică și a altor date de stare. Deși Cytoscape a fost proiectat inițial pentru cercetare biologică, acum este o platformă generală pentru analiză rețelelor moleculare și vizualizare complexă. Distribuție de bază Cytoscape oferă un set de bază de caracteristici pentru integrarea datelor, analiză și vizualizare. Sunt disponibile funcții adiționale sub formă aplicațiilor (formal denumite programe de integrare ). Aplicațiile sunt disponibile pentru analiză profilului reticular și molecular, a unor noi caracteristici, pentru suport adițional de formate de fișiere, codare și conectare cu baze de date . Acestea pot fi realizate de oricine folosind API Cytoscape bazat pe tehnologia Java ™ și dezvoltat de întrega comunitate.”

Download: https://sourceforge.net/projects/academix/files/mio/cytoscape-3.5.1_all.deb/download

Pachetul Cytoscape a fost realizat sub licență http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html

Întreg programul Cytoscape funcționează sub licență LGPL http://www.cytoscapeconsortium.org

Pachetul a fost testat pe distribuția AcademiX GNU/ Linux cât și pe Debian Stretch.

Instalare: synaptic, EDU sau în consolă

apt install cytoscape

Versiune: 3.5.1

Leave a Comment