Cytoscape

El paquete Cytoscape se basó en el programa desarrollado por http://www.cytoscape.org.

Según http://www.cytoscape.org

“Cytoscape es una plataforma de código abierto para ver redes de vías de interacción molecular y biológica y completar estas redes con anotaciones, perfiles de expresión génica y otros datos de estado. Aunque Cytoscape fue diseñado originalmente para la investigación biológica, ahora es una plataforma general para el análisis de redes moleculares y la visualización compleja. Distribución básica Cytoscape ofrece un conjunto básico de características para la integración, el análisis y la visualización de datos. Las características adicionales están disponibles en forma de aplicaciones (formalmente llamados programas de integración). Las aplicaciones están disponibles para el análisis de perfiles moleculares y reticulares, nuevas funciones, formatos de archivo adicionales, codificación y conexiones de base de datos. Cualquier persona puede hacer esto utilizando la API de Cytoscape basada en tecnología Java ™ y desarrollada por toda la comunidad “.

Descargar: https://sourceforge.net/projects/academix/files/mio/cytoscape-3.5.1_all.deb/download

El paquete Cytoscape fue licenciado en http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html

El programa completo Cytoscape se ejecuta bajo la licencia LGPL http://www.cytoscapeconsortium.org

El paquete se probó en la distribución AcademiX GNU / Linux, así como en Debian Stretch.

Instalación: synaptic, EDU o consola.

apt install cytoscape

Versión: 3.5.1

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