Química

Programas instalables en la sección de Química

BKchem

Descripción: Bkchem es una aplicación fácil de usar que te permite dibujar compuestos químicos simples 2D y estructuras moleculares en tu computadora sin ser un experto en dibujo (científico, estudiante). Dibujo: Actúa tirando de la cadena con la cuerda, definiendo la longitud de los enlaces y los ángulos con precisión (radicales, electrones libres e iones). Plantillas, (arrastre sus propios diagramas moleculares). Modifique el color de las moléculas, agregue anotaciones y, por supuesto, diseñe sus propios gráficos vectoriales simples (polígonos, círculos, flechas rectas y curvas, etc.) utilizando Sodipodi-Inkscape. Edición: Alineación, alineación automática, escalado y rotación (2D y 3D) deshacer / rehacer (modo ilimitado). Exportar: formatos PNG (con Pycairo instalado), SVG, PDF, ODF, OpenOffice Draw, PostScript encapsulado, Molfile, SMILES, InChI. Búsqueda: archivos BKChem para una molécula o fragmento de una molécula.

Autor: Beda Kosata

Sitio: http://bkchem.zirael.org/

Email: beda@zirael.org, rei4dan@gmail.com

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Chemtool

Descripción: Chemtool, es una pequeña aplicación utilizada en la edición 2D de estructuras químicas. Chemtool incluye muchos tipos de enlaces (filamentos): doble, doble centrado, triple, cuádruple, en forma de cuña, punteados, corrugados, líneas de puntos anchos, media flecha y otros: dibujando las moléculas orgánicas ligeramente y almacenándolas como archivos de mapa de bits X. Chemtool se basa en Transfig (Brian Smith’s) para la impresión y exportación PostScript de formatos de archivo Xfig (PicTeX y EPS) o archivos PostScript para la posterior anotación. Incluye un conjunto de muestras de estructura molecular, un programa auxiliar (CHT) para calcular la suma de la fórmula general y el peso molecular exacto en un archivo de dibujo de chemtool.

Autor: Martin Kroeker, Radek Liboska, Michael Bank y Thomas Volk

Sitio: http://ruby.chemie.uni-freiburg.de/~martin/chemtool/chemtool.html

Email: martin@ruby.chemie.uni-freiburg.de

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

GChemPaint

Descripción: GChemPaint es un editor de estructura química 2D simple para el escritorio Gnome-2. Puede usar JChemPaint para crear y editar archivos de química relacionados. GChemPaint ahora está incluido en Gnome Chemistry. GChemPaint ya no se desarrolla como un proyecto independiente sino que comienza con la versión.0.10.0. (Septiembre 2008) se integra en Gnome Chemistry Utils. GChemPaint está escrito en C ++ pero no usa Gtkmm.

Autor: Jean Brefort, Nestor Díaz.

Sitio: http://www.nongnu.org/gchempaint

Email: jean.brefort@normalesup.org

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Gelemental

Descripción: gElemental es un visor de tablas periódicas que proporciona información detallada sobre elementos químicos. Permite que los elementos sean coloreados temáticamente en base a la mayoría de las propiedades. La vista de lista muestra información de elementos clave y cualquier propiedad de elemento adicional, y puede ser clasificada por cualquiera de ellos. El cuadro de diálogo de propiedades de elemento muestra una variedad de información, que incluye propiedades históricas, termodinámicas, electroquímicas y cristalográficas. (Se encuentra disponible una lista completa de propiedades). El conjunto de datos gElemental se actualiza (derivado de fuentes académicas citadas) disponible a través de la biblioteca libelemental compartida. También está disponible un módulo Python, pyElemental, que admite múltiples idiomas. (Ver el estado de traducción para una lista.)

Autor: Kevin Daughtridge

Sitio: http://www.kdau.com/projects/gelemental/

Email: kevin@kdau.com

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Jmol

Descripción: Jmol es una aplicación Java independiente que se ejecuta en el escritorio para ver estructuras químicas tridimensionales.

Autor: Robert M. Hanson

Sitio: http://jmol.sourceforge.net/

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Rasmol

Descripción: RasMol es un programa de gráficos moleculares diseñado para visualizar proteínas, ácidos nucleicos y moléculas pequeñas. El programa tiene como objetivo mostrar, enseñar (en educación) y generar imágenes de calidad publicadas. El programa lee las coordenadas de una molécula en un archivo y muestra la molécula interactivamente en la pantalla en una variedad de esquemas de color y representaciones moleculares.

Autor: Roger Sayle

Sitio: http://rasmol.org/

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Xmakemol

Descripción: XMakemol es un programa basado en mouse escrito con el kit de herramientas LessTif para ver y manipular sistemas atómicos y otros sistemas químicos. Lee datos de entrada XYZ y genera átomos, enlaces químicos y enlaces de hidrógeno.

Autor: Mathew P. Hodges

Sitio: http://www.nongnu.org/xmakemol/

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Avogadro

Descripción: Avogadro es un editor molecular, diseñado para uso en química computacional, modelado molecular, bioinformática, ciencia de materiales y otros campos relacionados. Con Avogadro, los científicos y estudiantes pueden desarrollar composiciones moleculares tridimensionales que presentan una molécula desde cualquier ángulo. y la perspectiva. Hace que la manipulación molecular en 3D sea lo más liviana posible al crear sus propias estructuras de color con los botones del mouse y arrastrando moléculas en tres ejes. Una excelente herramienta científica que permite la flexibilidad para aquellos que desean desarrollar complementos, pero es bastante Fácil para que cualquiera lo use.

Autor:

Sitio: http://avogadro.cc/

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Caín

Descripción: Caín realiza simulaciones estocásticas y determinísticas de reacciones químicas. Puede iniciar múltiples procesos de simulación para usar computadoras multi-core. Almacena modelos, parámetros de simulación y resultados de simulación en un formato XML. Además, los modelos SBML pueden ser importados y exportados. Los modelos y parámetros de simulación se pueden leer desde los archivos de entrada o editados dentro del programa. Caín es una aplicación útil para calcular diferentes situaciones del mundo real que involucran múltiples reacciones que involucran múltiples variables aleatorias a través de la simulación. Sin embargo, ningún simulador garantizará una respuesta precisa a cualquier conjunto de reacciones.

Autor: Sean Mauch

Sitio: http://cain.sourceforge.net

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Easychem

Descripción: EasyChem es un programa diseñado para dibujar moléculas químicas escritas para Linux y que usan GTK 2. Aquí está la última versión, y aquí encontrará nuevas características y ayuda (con suerte, pronto). EasyChem, fue desarrollado por el autor después de usar otras herramientas de Linux capaces de dibujar estructuras moleculares (chemtool, xdrawchem, etc.) pero que no le dieron satisfacción. EasyChem sería un poco más difícil de aprender, pero cuando lo domines, puedes ser muy rápido y muy preciso. De hecho, es como una herramienta de dibujo vectorial especializada. Características: Dibuje fácilmente adornos (pares de electrones inalterados, …), exporte EPS con fuentes LaTeX (computadora moderna)

Autor: François-Xavier Coudert.

Sitio: http://easychem.sourceforge.net/

Email: fxcoudert@gmail.com

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

GDIS

Descripción: GDIS es un programa basado en GTK / OpenGL para mostrar y manipular moléculas aisladas y elementos periódicos del sistema. Es un programa perfecto, pero bastante funcional. Admite múltiples tipos de archivos (CIF, BIOSYM, XYZ, XTL, MARVIN), puede usar OpenGL, tiene herramientas de visualización agrupadas (medidas, estructuras lineales, visualización espacial), herramientas de edición útiles, incluyendo transformaciones de matriz y Visualización de imágenes en serie, cuenta con potentes herramientas para generar superficies y morfología cristalina, soporte para animación BIOSYM. Desarrollado originalmente en RedHat (plataforma Linux).

Autor: Sean Fleming

Sitio: http://gdis.seul.org/

Email: sean@power.curtin.edu.au

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Gperiodic

Descripción: GPeriodic es una aplicación basada en el Sistema Periódico de Elementos. Le permite navegar a través de los elementos en la tabla periódica y ver información detallada sobre cada uno de los elementos. En la actualidad se presentan 118 artículos.

Autor: Kyle R. Burton, Arno W. Peter, Jon Abbott, Andrew Dalke, Georges Khaznadar, Mauricio Rivera, Christian Klein, Lalo Martins, Ambrogio Oliva, Jonas Frantz, Costantino Ceoldo

Sitio: http://gperiodic.seul.org/

Email: mortis @ voicent.com, frantz @ beam.helsinki.fi, antigone34@libero.it

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Pymol

Descripción: PyMOL puede producir imágenes en 3D de alta calidad de moléculas pequeñas y macromoléculas biológicas, como las proteínas. De acuerdo con el autor original, casi un cuarto de todas las imágenes publicadas de estructuras de proteínas 3D en la literatura se realizaron utilizando PyMOL. PyMOL es una de las pocas herramientas de visualización de código abierto disponibles para su uso en biología estructural. Pantallas, densidades, superficies y trayectorias, también incluye edición molecular, trazado de rayos y películas.

Autor: Dr. Warren LyfordDeLano

Sitio: https://www.pymol.org/

Email: sales@schrodinger.com

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Kalzium

Descripción: Kalzium es una aplicación que le mostrará información sobre 103 elementos de la tabla periódica de elementos, incluida la masa, la tarea, la imagen, la información de vanguardia, los datos químicos y de energía, y un modelo del átomo. La tabla en sí puede configurarse para mostrar la numeración, el estado de la materia y la codificación de colores de diferentes maneras. Además, hay un índice de fechas disponible que permite que solo se muestren los elementos descubiertos hasta por un año. Por lo tanto, puede utilizar la aplicación como una base de datos de información.

Autor: Carsten Niehaus

Sitio: https://edu.kde.org/kalzium/

Email: cniehaus@kde.org

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

Viewmol

Descripción: Viewmol es una interfaz gráfica para aplicaciones de química computacional. Facilita gráficamente la generación de estructuras moleculares para los cálculos y para visualizar sus resultados. Viewmol se desarrolló originalmente en el grupo de Química Cuántica en la Universidad Humboldt, junto con las contribuciones: Arne Dummer, Mariann Krossner, Andreas Bünger y Andries de Man. Viewmol ha sido considerado un producto notable en los premios de software académico alemán / austriaco desde 1993. Viewmol se desarrolla en Linux. Por lo tanto, todos los derivados de Unix podrían funcionar.

Autor: Jörg- Rüdiger Hill, Andreas Bleiber

Sitio: http://viewmol.sourceforge.net/

email:

Arquitectura: 32/64 bit
Licencia: GPL
Idioma: ingles

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